مرحلة خروج المغلوب في دوري أبطال إفريقيا 2023–24 تبدأ في 29 مارس مع ربع النهائي وتنتهي في 25 مايو 2024 مع النهائي لتحديد بطل دوري أبطال إفريقيا 2023–24. سيتنافس ثمانية فرق في مرحلة خروج المغلوب.
سيتم لعب كل مباراة في مرحلة خروج المغلوب على مباراتين، حيث يلعب كل فريق مباراة واحدة على أرضه. الفريق الذي سيسجل أكثر أهداف في مجموع المباراتين سيتأهل إلى الدور التالي. إذا كانت النتيجة الإجمالية متساوية ، سيتم تطبيق قانون أهداف خارج الديار، أي أن الفريق الذي سيسجل أكثر أهداف خارج أرضه خلال مباراتي الذهاب والإياب سيتأهل. إذا كانت الأهداف خارج الأرض متساوية أيضا ، فلن يتم لعب وقت إضافي وسيتم تحديد الفائز من خلال ركلات الترجيح (اللوائح الثالثة 26 و 27).
آلية السحب لكل جولة ستكون على النحو التالي:
في قرعة ربع النهائي، سيتم تصنيف المتصدرين بالمجموعات الأربعة، وسيكون وصيف المجموعات الأربع غير مصنف. سيتم سحب الفرق المصنفة ضد الفرق غير المصنفة، مع استضافة الفرق المصنفة مباراة الإياب. لا يمكن سحب الفرق من نفس المجموعة ضد بعضها البعض، بينما يمكن سحب الفرق من نفس الاتحاد ضد بعضها البعض
في قرعة الدور نصف النهائي، لن يكون هناك تصنيف، ويمكن سحب الفرق من نفس المجموعة أو نفس الاتحاد ضد بعضها البعض. نظرا لأن قرعة ربع النهائي ونصف النهائي ستقام معا قبل لعب ربع النهائي، فلن تعرف هوية الفائزين في ربع النهائي في وقت قرعة نصف النهائي.